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一般問題
1.以培育科技農企業為起點，進而帶動科技農企業體系網絡健全發展，引領科技農企業扮演產業領頭羊協同衛星農場共同塑造產業競爭優勢。
2.為達成上述目標，農業部設置科技農企業資訊網作為資訊分享及學習平台，提供農企業相關產業新知或訊息，包含各式輔導資源申請、優質農企業案例介紹，如菁創獎、輔導案例、產業新知與企業經營文章分享等，方便農企業有效利用。
期望透過建置科技農企業資訊網，整合科技研發、經營管理、人才培力、創投資源、創新服務等輔導服務，以期推動科技農企業多元創新發展，以提升企業創新營運績效。
輔導資源
可以同時申請其他輔導資源，但受輔導單位不得以相同或類似本計畫之提案內容重複申請政府其他計畫，如經查證將取消獲選資格，並追回已核撥之輔導經費。
經相關單位推薦或自行申請之農企業，將安排電訪或是現地查訪，評估申請單位之輔導需求是否符合本計畫目標，及經由執行單位確認申請文件符合資格與整理申請案件順序後，由農業部與執行單位進行初審選出下一階段入選名單，透過召開審查會，邀請產官學代表擔任委員選出年度受輔導單位。從申請到審查時間因當年度申請案件數而有所調整，所需時間約2~3個月，每年於上半年完成相關審查作業。
由於政府相關計畫所需佐證資料較為嚴謹，為確保貴公司符合輔導申請資格，需備齊三份文件(1.廠商輔導基本資料表; 2.公司登記、商業登記或合作社相關登記文件;3.蒐集個人資料告知事項暨個人資料提供同意書)，而相關重要文件請加蓋章以資證明。
基本上當年度所公告之輔導類型依據每年的計劃資源與時事，及各方相關意見進行調整，請以該年度之申請須知為主，本年度類別分為科技農業潛力外銷體系整備輔導、微型農企業輔導與科技農業外銷產銷整合聯盟輔導，農業部與執行單位皆仍保有當年度輔導類型調整之權利。
凡是具科技能量之農民團體及農業產業團體，且符合下述兩項條件之業者皆具備科技農企申請資格：
1.基本條件: 非屬銀行拒絕往來戶，如屬依法在中華民國境內辦理登記之公司，其淨值（股東權益）須為正值。
2.經營型態: 可分為三種類型，包含:科技農企業、具科技能量之農民團體及具科技能量之農業產業團體。